WHO 发布使用下一代测序技术检测外源病毒的拟定国际参考标准品

世界卫生组织（WHO）于 9 月 7 日发布了拟议国际病毒参考标准品，用于通过下一代测序技术检测生物产品中的外源病毒。

该拟议基于一个国际研究小组的工作。该研究小组由美国 FDA 生物审评与研究中心的 Arifa Khan 领导，六个国家的八个实验室参加了这项研究，评估了五种参考种群的适用性，包括爱泼斯坦-巴尔病毒（EBV）、1型哺乳动物呼肠孤病毒（Reo）、人呼吸道合胞病毒（RSV）、猫白血病病毒（FeLV）和猪圆环病毒（PCV）。

研究小组在研究中使用了下一代测序（NGS）技术来寻找参考种群。挑战是，将这五种病毒每种病毒 10,000 个基因组拷贝，掺入到高滴度的腺病毒5（Ad5）背景中（10 亿个基因组拷贝），以评估在模拟病毒疫苗种子的基质中使用 NGS 的病毒检测广度。所有八个实验室都检测出了所有五种病毒，尽管检测出的级别不同。

测序是体内和体外病毒测定的一种越来越流行的替代方法，节约了实验动物，避免了体外测定的某些限制，并且速度更快。但是 WHO 的拟议指出，下一代测序需要标准品，从而可以针对生物制品申请进行验证。

研究参与者表示，他们喜欢这五种病毒代表不同病毒家族的基因组和物理特性的方式，以及表征包的完整性。但一个问题是它们以大的等量样品贮存。WHO 建议将样品解冻并分成较小的等量样品，然后再重新冷冻。

Khan 是美国微生物学会于 2017 年 9 月发表的一篇论文“评估病毒检测高通量测序性能的多中心研究”[1]的通讯作者。论文描述了三个政府实验室为支持方法标准化所做的早期努力 , 该方法通过在不同的细胞基质中掺入四种模型病毒来模仿生物制造环境。实验室使用了 WHO 文件中指明的五种病毒中的四种。论文呼吁人们关注这项技术，称其“意外在多种样本类型中发现了已知的和新型的病毒，多种样本类型包括研究物料、临床物料和生物制品。”

高通量筛选外来因子是防止病毒颗粒进入生产生物反应器的一种方法。病毒颗粒进入生产生物反应器会严重破坏生产运行并导致停产，就像 Genzyme 工厂在 2009 年发生的那样。【Genzyme某工厂与FDA签订合意判决的事件】

FDA 在今年 1 月发布的《人类基因疗法研究用新药申请的 CMC 信息》指南中就指出 , 外源因子和“随机质粒”已成为在基因治疗的合同生产中需要注意的问题，指南中包括了有关如何防止将外源因子引入基因治疗的广泛讨论。

参考资料
[1] Khan, Arifa S., et al. "A multicenter study to evaluate the performance of high-throughput sequencing for virus detection." Msphere 2.5 (2017).

整理：识林-蓝杉

       文章来源：识林

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