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使用灌流生物反应器的连续细胞培养技术是在三十多年前发展起来的。灌流生物反应器的运行需要不断添加营养物质，同时不断去除产物(以及可溶性杂质)，并周期性废弃多余细胞/细胞碎片，以保持几乎恒定的生物反应器体积和细胞密度。在这些系统中短暂的滞留时间对生产高度不稳定的产物特别有吸引力，因为这些产物容易在生物反应器中降解、聚集和/或蛋白水解。灌流系统的细胞密度可以比典型的补料分批生物反应器高出近10倍，从而提高生产效率。用于单克隆抗体生产的灌流生物反应器已经良好建立。
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