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酶标分析仪本质为一台变相光电比色计或分光光度计，基本工作原理与主要结构和光电比色计基本相同。光源灯发出的光波经过滤光片或单色器变成一束单色光，进入塑料微孔板中的待测标本。该单色光一部分被标本吸收，另一部分则透过标本照射到光电检测器上，光电检测器将这些光信号转换成相应的电信号，电信号经前置放大、对数放大、模数转换等信号处理后送入微处理器进行数据处理和计算，最后由显示器和打印机显示结果。微处理机还通过控制电路控制机械驱动机构X方向和Y方向的运动来移动微孔板，从而实现自动进样检测过程。有些酶标分析仪采用手工移动微孔板进行检测，省去了X，Y方向的机械驱动机构和控制电路，从而使仪器更小巧，结构也更简单。
分类：
按照功能不同酶标分析仪可以分为光吸收酶标仪，荧光酶标仪，化学发光酶标仪和多功能的酶标仪。
1.光吸收酶标仪
光吸收酶标仪是用来进行可见光与紫外光吸光度的检测。特定波长的光通过微孔板中的样品后，光能量被吸收，而被吸收的光能量与样品的浓度呈一定的比例关系，由此可以用来定性和定量的检测。光吸收的检测技术成熟，成本低，操作简单，但是动态范围窄，灵敏度比较低，特异性不强。一般可见光和紫外光分别采用钨灯及氘灯作为光源，而紫外/可见酶标仪是可以将两种光源进行切换，适应不同测量波长的需求。
2. 荧光酶标仪
荧光酶标仪是用来进行荧光的检测。通过激发光栅分光后的特定波长的光照射到被荧光物质标定的样品上后，会发出波长更长的发射光，通过发射光栅后到达检测器。荧光的强度与样品的浓度呈一定的比例。荧光检测灵敏度高，可实时检测，使用方便，检测模式多样，但是容易受外界干扰，激发光与发射光容易互相影响，干扰检测。
3. 化学发光酶标仪
化学发光酶标仪是来自生物化学反应中的自发光，可分为辉光型和闪光型两种类型。辉光型发光持久，稳定，能持续一段时间；闪光型发光时间短，变化快，稳定性不强，需要应用自动加样器才可以进行。化学发光酶标仪灵敏度非常高，动力学范围广。
4. 多功能酶标仪
多功能酶标仪是以上三种酶标仪的集合，集成了两种或者三种酶标仪于一体，可以同时进行光吸收，荧光和化学发光的检测，功能强大，使用范围广，可作为研究平台，避免了重复购买，是实验室的首选。
按照滤光方式的不同酶标仪可分为滤光片式酶标仪和光栅式酶标仪。
1.滤光片式酶标仪
滤光片式酶标仪采用滤光片来进行波长的选择，光源发出的全波谱光经过滤光片后，大部分被过滤，只剩下滤光片本身允许的波长通过，因此只能截取特定波长进行检测。
2. 光栅式酶标仪
光栅式酶标仪采用光栅进行分光，光源发出的全波谱光线经过光栅后，通过光栅上面分布的一系列狭缝的分光，就可以获得任意波长的光，波长连续可调。光栅式酶标仪使用方便灵活，可选择任意波长的光，也能进行全波长的扫描，通过全波长扫描可以获得未知样品的吸收峰，从而可以达到检测未知样品的目的。
用途：
酶标仪广泛地应用在临床检验、生物学研究、农业科学、食品和环境科学中，例如低紫外区的DNA、RNA定量及纯度分析（A260/A280）和蛋白定量，酶活、酶动力学检测，酶联免疫测定（ELISAs），细胞增殖与毒性分析，细胞凋亡检测（MTT），报告基因检测及G蛋白偶联受体分析（GPCR）等。特别在近几年中，由于大量的酶联免疫检测试剂盒的应用，使得酶标仪在生殖保健领域中应用越来越广泛，同时促进了生殖健康技术水平提高。
操作注意事项：
酶标仪的功能是用来读取酶联免疫试剂盒的反应结果，因此要得到准确结果，试剂盒的使用必须规范。许多医院在使用酶标仪之前是通过目测判断结果，操作过程随意性较大，在使用酶标仪后如果不能及时纠正操作习惯，会造成较大误差。在酶标仪的操作中应注意以下事项：
1. 使用加液器加液，加液头不能混用。
2. 洗板要洗干净。如果条件允许，使用洗板机洗板，避免交叉污染。
3. 严格按照试剂盒的说明书操作，反应时间准确。
4. 在测量过程中，请勿碰酶标板，以防酶标板传送时挤伤操作人员的手。
5. 请勿将样品或试剂洒到仪器表面或内部，操作完成后请洗手。
6. 如果使用的样品或试剂具有污染性、毒性和生物学危害，请严格按照试剂盒的操作说明，以防对操作人员造成损害。
7. 如果仪器接触过污染性或传染性物品，请进行清洗和消毒。
8. 不要在测量过程中关闭电源。
9. 对于因试剂盒问题造成的测量结果的偏差，应根据实际情况及时修改参数，以达到最佳效果。
10. 使用后盖好防尘罩。
11. 出现技术故障时应及时与厂家联系，切勿擅自拆卸。
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