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分析液相的目的当然是为了分析样品，有什么成分，含量多少，也叫做 定性定量。要做好分析液相，最关注的是分离度和灵敏度，要分得开，测得到，测得准。而 制备液相是利用色谱柱的分离能力，来去除杂质，得到 高纯样品。
为什么强调纯度呢？
在 实验室里，红外、紫外、核磁这些仪器，都要求样品达到足够的纯度，才能得到准确的结果。除了实验室， 药品的生产也需要纯化，特别是生物制品和药剂。很多生物制品如果是直接吃下去，跟吃个鸡蛋也没什么不同，直接注射才能保留活性成份。而注射治疗，药物会直接进入血液，所以纯度非常重要。在实验室里，用于制备的液相，配置和普通的分析液相差不多。有 泵，有 进样器，有 柱子，有 检测器。为了收集分离出来的化合物，制备液相通常还配一个 馏分收集器。馏分收集器就像液相色谱的收纳盒，把每次分析的同类物质收纳到一起。馏分收集器可以直接 串联在检测器后面。也可以连接一个三通，和检测器 并联，都接在色谱柱的后面。有些实验室里需要收集的量很大，一个馏分收集器装不完，还可以并联好几个。根据检测器的信号显示，当化合物出峰的时候，仪器会自动收集。一般按照 时间编程，也可以根据检测器的 信号强度自动触发。一个个化合物通过馏分收集器收集到小瓶或者试管里，也可以通过管路连接到更大的瓶子。制备液相有很多种分类方法，比如按 压力分类，或者按 产量分类，彼此之间有交叉，没有明确的标准。不同类型的制备液相有着不同的特点。比如这根用在 生产上的制备液相柱，模样和实验室里有些不同。仅仅内径就有1.6m，色谱柱的重量有36吨重，每天消耗的流动相能放满半个小游泳池。除了特别大的，还有特别小的。比如 微克级制备，也常被称为微量制备，它的有趣之处在于 微量馏分收集器，可以直接使用MALDI点样板。
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